Área del viejo Terminal  portuario (Sector 1 o sector antiguo) o terminal de Multipropósito con una superficie de 50 Ha. 

Área del Terminal de Contenedores con una superficie de 30 Ha. 

Área del Terminal de carga a granel que ocupa 17 Has. (Ya concesionado). 

Área de reserva en el sector NE que tiene una superficie de 80 Has. 

Área de manglares sector W que alcanza alrededor de 70  Has. 

El Puerto de Guayaquil está constituido por un Terminal convencional multipropósito, un terminal de contenedores y un terminal de carga a granel (ya concesionado). 

Para el desarrollo de sus operaciones APG cuenta además con bodegas (31) patios, módulos, muelles, silos de granos (5) y tanques de almacenamiento de aceites (3). Aproximadamente 10 Has. por patios y módulos. Las bodegas y módulos son administrados por Empresas Permisionarias.  

El Puerto cuenta con una Planta ecológica para el tratamiento de aguas de Sentina, Talleres mecánicos, de mantenimiento y comedores. 

En la zona noroeste está prevista la construcción de un Terminal para vehículos pesados.